大型水生植物也可以从水中吸收农药、工业化学物质等多种有机污染物，甚至持久性有机污染物。这些有机物进入植物体内后有着多种代谢机制，包括富集、转化和完全降解，如：狐尾藻可从水溶液中吸收2,4,6.三硝基甲苯（TNT）并在体内迅速代谢为高极性的2一氨基一4,6,一二硝基甲苯及脱氨基化合物。凤眼莲可直接吸收降解有机酚类。

　　最近的研究发现，黑藻（Hydrilla verticil-lata）可以吸收富集阿特拉津、林丹和氯丹，其富集系数分别为10.38和1060,浮萍可迅速吸收水中的氯酚以及氟氯化合物，但是这些化合物在浮萍体内并不能被降解而是被储存在细胞壁中。